Я лично всегда устанавливаю уже сборки, дело в том, что многие моды делают под определённую версию и если у вас будет, к примеру, старая, то вполне вероятно что мод работать не будет, а того глядишь и вообще игра крашнется. Поэтому вам рекомендую делать тоже самое. Ну а так, моды устанавливаются поверх игры, сами видя путь к игре. Также можно их кинуть в корневую папку с соответствующим названием, но это большой риск, может совсем не пойти.